Mechanizmy opornościowe Candida albicans/Candida glabrata w stosunku do naturalnych substancji antymikrobiologicznych /Resistance mechanisms of Candida albicans/Candida glabrata against natural antimicrobial agents
|
|
Opis w języku polskim |
Description in English |
|
Dyscyplina / Discipline |
biotechnologia | biotechnology |
|
Promotor / Supervisor |
dr hab. Grzegorz Chrzanowski, prof. UR gchrzanowski@ur.edu.pl |
dr hab. Grzegorz Chrzanowski, prof. UR gchrzanowski@ur.edu.pl |
|
Tytuł tematu badawczego / Title of the research topic |
Mechanizmy opornościowe Candida albicans/Candida glabrata w stosunku do naturalnych substancji antymikrobiologicznych | Resistance mechanisms of Candida albicans/Candida glabrata against natural antimicrobial agents |
|
Opis tematu badawczego / Description of the research topic |
Skuteczne zwalczanie patogenów wymaga poszukiwania substancji o wysokim powinowactwie i wysokiej toksyczności do bakterii i grzybów, jednocześnie nie wykazując szkodliwości w stosunku do zwierząt i owadów pożytecznych. Z drugiej strony mikroorganizmy mogą rozwinąć odziedziczoną lub nabytą zdolność oporności na działanie substancji przeciwbakteryjnych. W związku z tym konieczne jest zrozumienie oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe i należy zająć się kwestią jej rozprzestrzeniania. Typowanie organizmu na podstawie całkowitej ekspresji białka jest przydatne do zrozumienia rozwoju lekooporności. Ponadto analiza białek wykrywa ekspresję genetyczną i pokazuje charakterystykę gatunku na podstawie zmian morfologicznych. Profil białkowy jest kluczowym markerem zmiany oporności na leki przeciwgrzybicze. Badania prowadzone przez doktoranta (metodami HPLC/UHPLC i spektrometrii mas) będą dotyczyły analizy metabolitów wytwarzanych przez mikroorganizmy. Ponadto student przeprowadzi elektroforezę SDS-PAGE i/lub 2D oraz identyfikację białek (za pomocą LC-MS/MS) w celu sporządzenia profilu proteomicznego pod działaniem naturalnych środków przeciwdrobnoustrojowych. |
Effective pathogen control requires the search for substances with high affinity and lethal potency against microorganisms, without any toxicity to the animals and beneficial insects. Thus, it is necessary to target the pathogens as selectively as possible. On the other hand, microorganisms can develop inherited or acquired ability to resist the action of antimicrobial agents. Thus, it is necessary to understand antimicrobial resistance and its spread. Typing of the organism based on the total protein expression is useful for understanding the development of drug resistance. Moreover, analysis of the proteins detects the genetic expression and shows species characterization based on the morphological changes. Therefore, the protein profile is suggested as the key marker of a shift in antifungal resistance. Research conducted by the Ph.D. student (using HPLC/UHPLC and mass spectrometry methods) will involve the analysis of metabolites produced by microorganisms. Moreover, the student will conduct SDS-PAGE and/or 2D-electrophoresis and identification of proteins (LC-MS/MS) to draw a proteomic profile under natural antimicrobial agent treatment. |
|
Słowa klucze / Keywords |
metabolomika, SDS-PAGE, 2D- elektroforeza, identyfikacja białek, chromatografia cieczowa sprzężona ze spektrometrią mas | metabolomics, SDS-PAGE, 2D-electrophoresis, protein identification, liquid chromatography coupled mass spectrometry |
|
Oczekiwane kompetencje/umiejętności od kandydata na doktoranta / Expected competences/skills from the candidate for a PhD student |
|
|