Jest nam niezmiernie miło poinformować, iż pracownik Instytutu Nauk Fizycznych dr hab. Józef Cebulski, prof. UR wraz ze współpracownikami opublikował w czasopiśmie Scientific Reports wydawnictwa Nature artykuł pt. „FT-Raman data analyzed by multivariate and machine learning as a new methods for detection spectroscopy marker of platinum-resistant women suffering from ovarian cancer”

Tematyka artykułu dotyczy zjawiska platynooporności, które stanowi bardzo poważny problem w leczeniu raka jajnika. Niestety, do tej pory nie odkryto żadnego molekularnego, genetycznego markera, który mógłby być wykorzystany w przypisywaniu kobiet cierpiących na raka jajnika do grupy opornej lub wrażliwej na platynę. Dlatego w badaniu po raz pierwszy wykorzystano spektroskopię FT-Raman do określenia różnic chemicznych i markerów chemicznych występujących w surowicy, które mogłyby być wykorzystane do różnicowania kobiet platynoopornych i wrażliwych na platynę. Uzyskane wyniki wykazały, że w surowicy pobranej od kobiet opornych na platynę zaobserwowano znaczny wzrost związków chemicznych w porównaniu z surowicą pobraną od kobiet wrażliwych na platynę. Co więcej, zmniejszenie stosunku między drganiami amidów i przesunięcia pików, odpowiednio, odpowiadających drganiom rozciągającym C-C/C-N z białek, amidu III, amidu II, drganiom C = O i CH lipidów sugerowało, że w tych związkach nastąpiły zmiany strukturalne. Analiza głównych składowych (PCA) wykazała, że przy użyciu zakresu FT-Raman, w którym występowały wyżej wymienione grupy funkcyjne, możliwe było rozróżnienie surowicy pobranej z obu analizowanych grup. Co więcej, drzewo decyzyjne C5.0 wyraźnie pokazało, że przesunięcia Ramana przy 1224 cm-1 i 2713 cm-1 mogą być wykorzystane jako marker oporności na platynę. Co ważne, metody uczenia maszynowego wykazały, że dokładność, czułość i swoistość spektroskopii FT-Raman wynosiły od 95 do 100%.

Link do artykułu: https://www.nature.com/articles/s41598-023-48169-3

Autorzy:

• Marta Kluz-Barłowska, Department of Pathology, Fryderyk Chopin University Hospital, Rzeszow, Poland
• Tomasz Kluz, Department of Gynecology, Gynecology Oncology and Obstetrics, Fryderyk Chopin University Hospital, Rzeszow, Poland
• Wiesław Paja, Institute of Computer Science, College of Natural Sciences, University of Rzeszow, Rzeszow, Poland
• Jaromir Sarzyński, Institute of Computer Science, College of Natural Sciences, University of Rzeszow, Rzeszow, Poland
• Monika Łączyńska-Madera, Department of Gynecology, Gynecology Oncology and Obstetrics, Fryderyk Chopin University Hospital, Rzeszow, Poland
• Adrian Odrzywolski, Department of Biochemistry and Molecular Biology, Medical University of Lublin, Lublin, Poland
• Paweł Król, College of Medical Sciences, Institute of Physical Culture Studies, University of Rzeszow, Rzeszów, Poland
• Józef Cebulski, Institute of Physics, College of Natural Sciences, University of Rzeszow, Rzeszow, Poland
• Joanna Depciuch, Institute of Nuclear Physics Polish Academy of Sciences, Krakow, Poland

Fot. Unsplash